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研究方向: |
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 生物信息学、功能基因组学与计算系统生物学
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| ＊基因的转录调控、剪接调控及RNA调控 |
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| ＊复杂疾病的基因组学、蛋白质组学与系统生物学分析 |
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| ＊基因组信息结构分析与非编码区转录与功能研究 |
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| ＊基因组人群多样性与重组规律研究 |
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| ＊表观遗传学及蛋白质修饰研究 |
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| ＊生物医学知识挖掘 |
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| ＊中医药的系统生物学研究 |
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| ＊复杂生物系统的分析与建模 |
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智能信息处理的理论与方法研究
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| ＊模式识别与机器学习的理论、方法与应用 |
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| ＊海量、异质数据的处理与挖掘 |
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| ＊复杂系统理论与分析方法 |
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| ＊图像处理与分析 |
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| ＊统计推理的理论与方法 |
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医学信息学与医疗信息化的基础探索
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| ＊分子影像学关键技术研究 |
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| ＊计算机辅助医学诊疗系统 |
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| ＊医学与公共卫生系统的信息化（eHealth） |
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| ＊生物统计学与流行病学 |
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队伍情况: |
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部主任：
张学工 博士
生物信息学与模式识别教授
生物信息学教育部重点实验室副主任
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主要研究人员介绍:
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李衍达院士
生物信息学与信息处理教授
中国科学院院士
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Michael Q. Zhang博士
生物信息学与计算生物学长江学者讲座教授
美国冷泉港实验室教授
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李梢 医学博士
生物信息学与系统生物学副教授
研究部副主任
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江瑞 副教授
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汪小我 讲师
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古槿 讲师
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刘莉扬 实验工程师
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讲席教授组成员简介: |
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Michael S. Waterman
教授于密西根大学统计系获博士学位，
先后曾在美国Los Alamos国家实验室
和爱达荷州立大学工作，并于1982年
加入南加州大学（USC）工作至今.他
于1995年获得古根海姆学者奖
(Guggenheim Fellow)，同年当选美国
艺术与科学研究院院士，并于2001年
当选美国国家科学院院士.他在2002年
获得了盖尔德诺（Gairdner）基金会
国际奖，并在2005年被评选为法国科
学院院士. 此外他还是美国科学促进
会院士（Fellow of the American
Association for the Advancement
of Science）和美国数理统计学会
(Institute of Mathematical
Statistics)院士，并曾担任Celera
基因公司首席顾问.
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Michael Q. Zhang
于1987年获Rutgers大学物理学博士
学位，主要从事计算分子生物学和生
物信息学方面研究，目前是清华大学
长江教授和美国冷泉港实验室(CSHL)
教授. 他的研究方向为：结合最新的
生物实验技术结合，利用统计和机器
学习方法发现和识别生物序列和信号
传导通路中能调控基因表达的遗传功
能元件. 他近期的工作主要集中在对
遗传（genetic）和表观遗传
（epigenetic）顺式调控元件的识别、
基因组和染色质结构分析以及基因
调控网络研究。
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Wing Wong
是美国斯坦福大学统计系教授. 他的
实验室主要开发用于分析各种高通量
基因组实验数据的方法和软件。具体
研究内容包括数据分析，多变量分析，
信息理论，蒙特卡罗采样，图论，线
性及非线性方程，以及它们在计算分
子生物学和系统生物学中的应用。
近期，他的实验室利用生物实验和
计算分析相结合的方式对生物发育
过程中的顺式调控机制展开了研究。
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Jun Liu
1991年获芝加哥大学统计学博士，目
前是美国哈弗大学统计系教授. 他因
在统计领域的杰出贡献获得了美国
2002年COPSS 总统奖。他主要从事计
算生物学、生物信息学和统计遗传学
方面的研究，尤其是利用贝叶斯推理
和马尔可夫蒙特卡罗(MCMC)方法来解
决统计数据缺失问题。
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Tao Jiang
于1988年获明尼苏达大学计算机科学
博士学位，目前是加州大学河滨分校
计算机系教授。他的研究方向包括算
法设计与分析、计算生物学、生物信
息学以及有限自动机模型复杂度分析。
近期研究的主要内容为序列比对与注
释、植物和细菌的比较基因组学研究、
转录因子结合位点分析以及基于遗传
谱系的单倍体推断等。
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Fengzhu Sun
1994年获南加州大学应用数学博士，目
前是南加州大学生物数学系教授.他的
研究领域主要包括计算生物学、生物信
息学、统计遗传和数学建模等.他近期
的具体研究方向为如何分析蛋白质-蛋
白质相互作用网络、单核苷酸多态性
(SNPs)、基因表达调控、连锁不平衡等
各类数据，以及将这些数据和方法用于
分析基因调控网络、预测蛋白质功能以
及识别致病基因。
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重要研究成果:
 Fan, SC; Zhang, XG CpG island methylation pattern in different human tissues and its correlation with gene expression BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 383(4),p421-425 2009
Li, H; Xiao, J; Li, JM; Lu, L; Feng, S; Droge, P Human genomic Z-DNA segments probed by the Z domain of ADAR1 NUCLEIC ACIDS RESEARCH 37(8),p2737-2746 2009
Peng, T; Li, Y Tandem exon duplication tends to propagate rather than to create de novo alternative splicing BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 383(2),p163-166 2009
Jiang, R; Tang, WW; Wu, XB; Fu, WH A random forest approach to the detection of epistatic interactions in case-control studies BMC BIOINFORMATICS 10 2009
Pei, YF; Zhang, T; Renault, V; Zhang, XG An overview of hepatocellular carcinoma study by omics-based methods ACTA BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA SINICA 41(1),p1-15 2009
Li, TT; Huang, J; Jiang, Y; Zeng, Y; He, FC; Zhang, MQ; Han, ZG; Zhang, XG Multi-stage analysis of gene expression and transcription regulation in C57/B6 mouse liver development GENOMICS 93(3),p235-242 2009
Fan, SC; Zhang, XG Progress of Bioinformatics Study in DNA Methylation PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS 36(2),p143-150 2009
Wang, XW; Xuan, ZY; Zhao, XY; Li, YD; Zhang, MQ High-resolution human core-promoter prediction with CoreBoost_HM GENOME RESEARCH 19(2),p266-275 2009
Wu, XB; Liu, QF; Jiang, R Align human interactome with phenome to identify causative genes and networks underlying disease families BIOINFORMATICS 25(1),p98-104 2009
Zhang, YL; Ji, L Main-Effects Model Is a Special Kind of Additive Model in the Presence of Linkage Disequilibrium HUMAN HEREDITY 67(1),p13-25 2009
Zhang, MQ; Waterman MS; Zhang X Introduction: the seventh Asia Pacific Bioinformatics Conference (APBC2009) BMC Bioinformatics 10 2009
Du P; Jia L; Li Y; CURE-Chloroplast: A chloroplast C-to-U RNA editing predictor for seed plants BMC Bioinformatics 10 2009
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相关照片
实验室活动
实验室研究及成果
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